Neue Software für die Analyse von RNA-Fusionen
Das Leipziger Unternehmen ecSeq Bioinformatics GmbH hat in seiner Analysesoftware für NGS-basierte genetische Tests Seamless NGS ein neues Modul zum Nachweis von Fusionsereignissen integriert.
Analysen auf höchstem Niveau
Zum Vergleich der Analyse wurde eine Verdünnungsstudie herangezogen, bei welcher Referenzproben mit bekannten RNA Fusionen in verschiedenen Verdünnungsgraden vermischt werden. Die Auswertung der Ergebnisse ergab, dass Seamless NGS bei der Detektion der CBFB-MYH11 Fusion nicht nur die Empfindlichkeit der vorherigen Auswertung erreicht, sondern diese um eine Größenordnung übertrifft. Während die zu dem Assay gehörende Archer®-Analysis Software die Fusionen bei einer Verdünnung von 1:10 bis 1:1,000 detektieren konnte, gelang dies Seamless NGS bei einer Verdünnungen bis zu 1:10,000.
Seamless NGS – Einer für Alles
¢ ist eine Software, die neben DNA-Mutationen (SNVs), Insertionen/Deletionen (InDels), Kopienzahlvariationen (CNVs) auch RNA-Fusionen detektieren kann. Da Panels verschiedenster Anbieter (Archer®, QiaSeq®, Illumina®, Twist Bioscience®, etc.) analysiert werden können und auch keine Limitierung in Bezug auf Sequenziermaschinen (Illumina®, IonTorrent®, MGI®, etc) besteht, ist die Software ideal für Labore geeignet, welche ihren Kunden ein breites Angebot an unterschiedlichen NGS-basierten genetischen Tests anbieten wollen.
c-LEcta, ein weltweit agierendes Biotechnologie-Unternehmen mit Technologieführerschaft im Enzym-Engineering und der Bioprozess-Entwicklung, arbeitet mit „World Courier“ zusammen, einer Firma der AmerisourceBergen Gruppe. Mit einer Präsenz in mehr als 50 Ländern ist World Courier von der Entschlossenheit zu herausragender Leistung angetrieben und bietet maßgeschneiderte Lösungen mit globaler Reichweite, um den Zugang zu medizinischer Versorgung zu verbessern; daher vertrauen auch viele der Kunden c-LEctas aus der Pharmaindustrie auf World Courier als Speziallogistiker.
Mit dem „Virtual Accelerator for Smart Data, Medical Devices and Therapies @ Leipzig Heart“ wird jungen Medizintechnik-Unternehmen der letzte Schritt bis zum Markt erleichtert. Aber ab Anfang 2021 plant man in Sachsen noch größer. Die regulatorischen Rahmenbedingungen und Anforderungen der MedizintechnikBranche stellen Start-ups und Gründerteams vor besondere organisatorische und finanzielle Herausforderungen. Hier setzt der Accelerator des sächsischen Branchenverbands für Biotechnologie und Medizintechnik – biosaxony e. V. – des Leipzig Heart Institutes und des Herzzentrums Leipzig an.